如您所知，近年來，以基因組科學(xué)為代表的研究工作和技術(shù)平臺先后獲得各項資助，如國家863計劃、973計劃、中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程、國家重大攻關(guān)項目、自然科學(xué)基金等。為了輔助廣大科研工作者掌握高通量測序技術(shù)原理、實驗設(shè)計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，我中心特舉辦此“實用生物信息學(xué)研討班”。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實踐基地

支持單位：肽度TIMEDOO

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022年11月7-11日（周一—周五）??上午9:30-12:00 ?下午13:30-17:00

日期 主題 內(nèi)容 備注
第一天 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 1、組學(xué)研究概述（基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹）

2、實驗設(shè)計及測序原理

3、生物信息學(xué)背景知識介紹

 理論
Linux服務(wù)器使用入門 1、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點講解）

2、掌握Linux環(huán)境下軟件的安裝使用

3、了解Shell腳本的編寫

 實戰(zhàn)
R語言入門 1、R語言簡介

2、R語言安裝及配置

3、R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)

4、R語言數(shù)據(jù)處理

5、R語言繪圖

 理論+

實戰(zhàn)
第二天 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 1、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動態(tài)

2、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點

3、常用的轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及測序建庫技術(shù)

4、轉(zhuǎn)錄組分析方法介紹

 理論
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實例（上機(jī)操作） 1、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹及安裝

2、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點講解）

3、表達(dá)量估計和分析（重點講解）

 理論+

實戰(zhàn)
第三天 基因組重測序與數(shù)據(jù)分析 1、講解基因組重測序的概念、目的與應(yīng)用

2、結(jié)合實例講解其原理、數(shù)據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關(guān)知識

 理論
基因組重測序數(shù)據(jù)分析實例（上機(jī)操作） 1、對二代測序數(shù)據(jù)的解讀

2、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)過濾

3、使用BWA和Samtools進(jìn)行數(shù)據(jù)比對并對比對結(jié)果進(jìn)行可視化（重點講解）

4、尋找SNP和Indel并進(jìn)行注釋（重點講解）

5、尋找結(jié)構(gòu)變異并對變異進(jìn)行注釋（重點講解）

 理論+

實戰(zhàn)
第四天 microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 1、microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展

2、microRNA的生物學(xué)過程

3、microRNA研究的實驗設(shè)計及測序原理

4、microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點講解）

5、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來的研究前景

6、microRNA測序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點講解）

7、近期文獻(xiàn)

 理論
microRNA數(shù)據(jù)分析實例（上機(jī)操作） 1、microRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點講解）

2、測序數(shù)據(jù)長度分布計算

3、microRNA的預(yù)測（重點講解）

4、microRNA堿基偏好性計算

5、microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測，結(jié)果提取、統(tǒng)計（重點講解）

 理論+

實戰(zhàn)
第五天 10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析原理 1、單細(xì)胞測序技術(shù)研究現(xiàn)狀及應(yīng)用

2、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及建庫測序原理（重點介紹10× Genomics）

3、空間轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及建庫測序原理

 理論
10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析流程上機(jī)操作 1、10×單細(xì)胞軟件Cellranger處理測序原始數(shù)據(jù)實戰(zhàn)

2、R包Seurat細(xì)胞分群、umap、t-sne、marker基因篩選實戰(zhàn)

 實戰(zhàn)
蛋白結(jié)構(gòu)與互作分析 1、PyMol

2、Cytoscape

 實戰(zhàn)

注：內(nèi)容以實際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會提前通知。

【報名費用】

注冊費：5400元/人（含當(dāng)期聽課費、資料費、證書費、考試費（如有））。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報，可免費贈送一個名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

【付費方式】

手機(jī)銀行或電子銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款等

單位全稱：北京市計算中心有限公司

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